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ファイザー、AWS上のサーバーレスアーキテクチャを使用してデジタルバイオマーカーの処理を拡張
ファイザーは、デジタルバイオマーカーデータを大規模に処理するためのサーバーレスアーキテクチャをアップグレードし、より柔軟で設定可能なものにした。彼らは、AWS Step Functionsと他のサーバーレスサービスで構築されたファイル処理パイプラインと、データ取り込みと処理のためのカスタムPythonパッケージを使用するフレームワークを作成した。
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DeepMindのAlphaFold2 AIが50年来の生物学の課題を解決
タンパク質構造予測センターはAlphaFold2がタンパク質構造予測の課題を解決したことを発表した。AlphaFold2はDeepMindによって開発されたAIシステムである。AlphaFold2は、グローバル距離テスト(GDT)メトリックで92.4の中央値スコアを達成した。これは、従来の方法との競合と見なされるしきい値を上回っている。
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リアルタイムの単一癌細胞分析に使用されるMLを活用したバイオチップ
UCIの研究者とエンジニアは最近、単一細胞レベルで癌と健康な組織を検査して区別できる機械学習支援バイオチップを作成した。そのデバイスによって生成されたデータは、腫瘍の不均一性を研究するために使用できる。これは、癌治療への抵抗を低減するのに役立つ。
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マイクロソフトがクラウドベースの生物学研究ツールをオープンソース化
マイクロソフトのクラウドベースのツールBio Model Analyzerは、生物学者が細胞の相互作用やコミュニケーションのモデル化に使うことができ、GitHubのオープンソースとして利用できるようになった。Bio Model Analyzer (BMA)を使用して、健康な細胞と罹患した細胞のプロセスを比較できるコンピュータモデルを作成できる。科学者は数百万の遺伝子とタンパク質との相互作用を見ることができるようになり、研究や罹患の治療をスピードアップすることができる。
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ClouderaがBroad Instituteとの提携を発表
ClouderaはMITとハーバードのBroad Instituteとの提携を発表するとともに,ゲノム解析ツールキットパイプラインに関する経験を公開した。
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Window Azure で動作する NCBI BLAST
Microsoft は同社 Windows Azure プラットフォーム上で NCBI BLAST の提供を開始した。NCBI BLAST は米国保健社会福祉省の一部門である国立生物工学情報センタに勤務する研究者グループによって開発された。NCBI では BLAST について,タンパク質およびDNA 連鎖の “配列間の局所的類似性を検索” するツールである,と説明している。
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オープンソース・プロジェクトによりMicrosoftが生命工学の市場に参入
Microsoft Biology Foundation(MBF)は、.NETフレームワーク上に構築されたライブラリ群であり、オープンソースの伝統に基づいている。Microsoftは、車輪の再発明をすることなく、既に生物情報工学のコミュニティで利用されているファイルフォーマットを活用している。さらにMicrosoftにとってはめずしいことだが、MBFの将来バージョンに加えられる貢献を広く募集しているのだ。